ヒューマンバイオロジー学位プログラム開設プログラム「Genomics database access and application」の課題として、取り組んだ内容を残しております。
「パブリッシュされたデータを取得し、再解析する」という課題内容に対し、私は下記論文のFastq取得～上流解析までをRを用いて行いました。
SAP97 regulates behavior and expression of schizophrenia risk enriched gene sets in mouse hippocampus
doi: 10.1371/journal.pone.0200477
解析結果の要約はPDFに、ソースコードはAnalysis.Rに記述しております。