Rotina Ficocianina em Python

Rotina em Python para análise de Ficocianina.

Execução

Para executar o código é necessário instalar as seguintes tecnologias:

• Python
• Anaconda

Clone o repositório com o comando:

git clone https://github.com/LabISA-INPE/rotina-ficocianina-python.git

Com o Anaconda Prompt e na raiz do projeto, instale as bibliotecas necessárias no arquivo de ambiente:

cd path/rotina-ficocianina-python

Observações:

• Confira o nome e o caminho do arquivo de ambiente e, caso necessário, modifique na linha de comando abaixo.
• Também é possível modificar o nome do ambiente (neste caso está com o nome ficocianina).
• Caso seja necessário, altere o arquivo de entrada na linha 5, do arquivo main, dentro das aspas. Veja o exemplo abaixo:
• df = pd.read_csv("C:/path/rotina-ficocianina-python/input/Altere_Aqui", delimiter="\t", decimal=",", index_col=0)
• Cole as linhas de código a seguir no Anaconda Prompt.

conda env create --name ficocianina --file environment.yaml

Após isso, ative o ambiente:

conda activate ficocianina

Rode o código em Python:

python main.py

Importante: em caso de erro confira o arquivo selecionado para ánalise.